李思行的亲兵见主将被杀，都朝着独孤彦云拼命，但数百名隋军骑兵已将他们团团围住，只片刻，这两百多名亲兵都被杀死在地，尸体堆满一地。
独孤彦云回马观看赫连楚、若干朝，却发现二将已经死得不能再死，心中又悔又痛，若非自己下令，他们二人也不会遭到李思行暗算，但事已至此，他只得无可奈何下令：“把二位将军尸首送回大营！”
而唐军这边，因为李思行被杀，如同无头苍蝇一般，组不起有效的阵式，被隋军纷纷杀死，而逃跑之路又被薛万均率领数万大军封死，侥幸活着的士兵只好向隋军投降，薛万均下达命令，要求停止杀戮，把剩余唐军带出大营，这一战，唐军被杀的士兵足有五千余人，余者尽皆投降了隋军。
……
由于事先安排得当，没有一名唐军能沿原路逃回，也为薛万均保守了秘密，为歼灭李仲文创造了先决条件，再加上他手中还有熟知敌情的许世绪帮忙欺骗，所以南部县的战争并没有传到李仲文耳中，使其毫无戒备的继续南下，进入了隋军的埋伏圈。
于翌日正午，这路大军被隋军集中歼灭在了横贯南部县东西的沈水南岸。
随着李仲文战死、大军全军覆没，巴西境内只剩下西水县匹娄武彻部、相如县李高迁部。
前者本来是有五千名士兵，可是被虞湛一把大火烧死了千余人，当虞湛接到薛万均的捷报之后，率部潜入匹娄武彻的新大营，把敌军主将匹娄武彻、裴怀节刺杀在大帐之内，然后又借南方之势招降这三千多名士气萎靡的唐军士兵。
而李高迁虽有一万五千余人，但他们却被声势浩大的隋朝大军团团围困在县城之内，根本无力反击，随着各种不利消息的传来，全军上下惶恐不安，李高迁意图死战到底，当唐朝的忠臣，但他麾下的将士可不想为伪唐殉葬，是以由几名将领悄悄碰头，然后打开城门，迎接隋军入城。
李高迁见隋军浩浩荡荡的杀入城中，而麾下将士不作抵抗，纷纷弃械投降，深知势不可为，长叹一声，朝成都方向拜了九拜，然后拔剑自刎。
巴西境内的战事进行到这步田地，已经没有了正规的唐军队伍，各县纷纷易帜、献城降隋。
薛万均委任于钦明为巴西郡检校太守、贺兰师仁为检校郡丞，暂时执掌全郡军政，负责安抚地方、恢复民生；又让韩荣、怡先统御五千士兵听命二人麾下，负责剿灭各县乱兵、流寇。自己则从相如县率领主力大军向长江县挺进，把战火推向遂宁郡。
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